周云带领大军赶到沂州后，立即接到朱震的命令，调集沂州、兖州所有兵马加上北上不久的黄得功、刘肇基两部共十二万五千人马，以黄得功为统帅，周云、蒋健为副，全力围剿在沂州、兖州一带流动捣乱的袁宗第部贼军。
袁宗第见官兵势众，不敢正面决战，只把当初做流寇时那套流动作战的战法拿了出来，回旋于兖州、沂州、莒县、枣庄一带，令官兵束手无策，最后黄得功采用周云分兵作战，协力围剿，正面逼进，背后设伏的策略，由黄得功部和袁宗第战于邹县。。黄得功不敌，向南退却，袁宗第追之，至藤县，再战，蒋健、刘肇基闻讯来援，袁宗第为了避免落入官兵包围圈，向西撤退，黄得功、刘肇基合兵追之，蒋健却不知所踪。
袁宗第逃至凫山时，落入周云的埋伏圈，袁宗第拼死突围，东方有追兵，北方有兖州坚城，西方有周云挡道，袁宗第只得向南走，准备从凤阳府绕回河南去，行至独山湖时，却又落入蒋健的埋伏，再次大战，最后袁宗第只带着四五千起兵逃了出去，经凤阳丰县转回河南归德府。。
至此，山东南方彻底稳固，蒋健、周云仍然驻守兖州、沂州一带，黄得功、刘肇基火速带兵进京支援朱震。因为此时朱震主力大军正分兵两路，一路就在北京城同金虏决战，一路追杀李自成未归！
原来，那日李自成和金虏各自回营休息，李自成觉得甚怪，按道理，刘芳亮应该能在中午赶来的，可现在到了傍晚，为何却连一个人影都没瞧见？就算是在路上遇到意外，也应该派人来通知一声吧。
没办法，他只好派人出去打探消息。。到了子夜时分，打探消息的人气喘喘的跑回来，大惊失色的说道：“刘芳亮将军被山东军困在大房山上，数次冲突都不得出，恐怕是凶多吉少。”
李自成听了，心中忍不住就要吐血，他破口大骂道：“朱震这厮，竟然又出尔反尔，不是说好不偷袭我军么？”他又叫来顾君恩，大骂了一通，让他立刻去找朱震理论。
顾君恩没法子，只好星夜来到宛平城下，城上巡夜的士卒放下吊框，把他拉进城去。此时山东军将士多半已经睡着，顾君恩见不着朱震，就在城里大吵大闹起来。朱震被吵醒后，睡眼星星的看着顾君恩，还未等他说话，先破口大骂道：“你好没道理，半夜三更跑来打搅我睡觉，看在李自成的面子上我绕过你一回，有什么事明天再说，还敢再闹我立即把你砍了。”
顾君恩道：“王爷就是砍了我也要说，你分明答应我不趁我大顺军和金虏交战时偷袭的，现在能够怎么出尔反尔呢？这样何足以取信天下。”
朱震喝道：“本王答应的是不趁你们和金虏交战之时偷袭吧，可是刘芳亮部有和金虏交战了么？更何况我偷袭他是在你军和金虏交战之前。你回去罢，本王一向一言九鼎，说不偷袭你们就决计不会的，你们明天可放心的继续和金虏交战，本王心情好就来城上观战，心情不好就在宛平睡大觉！。”
顾君恩被朱震赶走后，没得法子，只好回到北京城里，把朱震的话如实禀报给李自成。李自成听了大怒，认为顾君恩和朱震串通，欺骗于他，下令把顾君恩监禁起来。
第二天多尔衮又来搦战，李自成避战不过，只得带着兵马继续同金虏厮杀。如此有杀了五天，李自成每天损失的人数都是金虏的几倍，在兵力上开始不占优势起来。
兵力落入下风，士兵战斗力又远远不如，指挥作战的能力更加及不上多尔衮，李自成顿时陷入了被金虏压着打的困境。最后李自成干脆躲在内城里不出来，向凭借城池死守些日子。
多尔衮每日驱动兵马攻城，攻打了十来天，虽然没有攻下来，但坚固的城墙却被金虏的红衣大炮轰得破烂不堪了。
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