离开大傻谷后，三人继续旅行，在路上的一个神奇宝贝中心小智给大木博士打了一个电话。(Www.K6uk.Com)
“小智，那些化石盔，菊石兽和化石翼龙是你们在大傻谷里抓来的，那里面还有没有了”大木博士一接电话就开始询问小智。
“没错，是我们抓的，它们还好吧，而且大傻谷里剩余的都让他们沉睡了，我抓了联盟应该没意见吧”小智猜大木博士已经知道大傻谷出现了化石神奇宝贝。
“没问题，我说你是我安排的人，我会好好照顾它们，它们全都刚刚醒来，要经过一段时间的调养才能恢复过来，既然大傻谷剩余的都沉睡了，我们就不应该打扰，我会和联盟反应的”大木博士知道小智很关心神奇宝贝，这话让小智安下心来“小智，它们借我研究没问题吧”
“没问题，你只要帮我照顾好它们就行了”虽然大木博士研究神奇宝贝很尽心，但有时会不顾自己的危险，如果发现稀有的神奇宝贝，那他就会死缠烂打的黏着对方。好在大木博士有很强的神奇宝贝和我的五员老将，不会有太大的危险。
在神奇宝贝中心，波克比也在小霞的期待中诞生了。
“啊，好可爱，波克比你好啊”
“叫尅布哩~”波克比高兴的叫道，就这样小霞收服了波克比。
而这天，小智一行人继续向着红莲道馆前进，在路上碰到了一位大叔要求进行神奇宝贝的对决，小智当然是来者不拒。
“上吧，铁甲犀牛”大叔派出的神奇宝贝是铁甲犀牛。
“咦～是铁甲犀牛”瑟蕾娜惊呼到，在她那铁甲犀牛大都用来骑，而不是用来战斗。www.83kxs.com
“妙蛙种子就决定是你了”小智看到大叔就知道到那个不可思议花园了，所以派出妙蛙种子。
“铁甲犀牛，使用猛撞攻击”大叔率先下令，然后铁甲犀牛就向着这边冲了过来。
“妙蛙种子寄生种子，然后睡眠粉”看着铁甲犀牛向妙蛙种子撞了过去，小智对妙蛙种子下令，像这种横冲直撞的都是很好的活靶子。虽然妙蛙种子被撞飞，但寄生种子和睡眠粉成功命中铁甲犀牛，铁甲犀牛不断被吸收体力而且摇摇欲睡，寄生种子吸收体力补回妙蛙种子，妙蛙种子可以很快的恢复伤势。
“铁甲犀牛振作啊”大叔没想到会是这种情况。
“妙蛙种子最后一击，飞叶快刀”妙蛙种子飞出许多叶子，铁甲犀牛因为被睡眠不能动，草系对地面系和岩石系效果拔群，而且还是加强版的飞叶快刀，铁甲犀牛直接失去了战斗能力。
“妙蛙种子干的好”小智跑过去摸了摸妙蛙种子说。
“哒奈~”可是就在这时，妙蛙种子痛苦的叫道
“妙蛙种子你没事吧，难道是…我马上送你去神奇宝贝中心”小智看到妙蛙种子背上的种子开始发光，但很痛苦，小智知道它正在抗拒进化，所以就抱着妙蛙种子向神奇宝贝中心冲去。
“大伙，我们快去神奇宝贝中心”小霞也看到妙蛙种子一脸痛苦，也没说什麽，跟小智一起跑向神奇宝贝中心。
终于在傍晚，小智等人赶到了神奇宝贝中心，并且把它交给了乔伊小姐。
“你的妙蛙种子没事，只是出现进化的征兆罢了，不过看起来它好像在抗拒进化”在认真检查下，乔伊对在外等待着的小智说。